Se stoupající ručičkou teploměru se zvyšuje i počet míst, ve kterých se zhoršuje kvalita vody ke koupání. Jedním takovým je i rybník Hejtman, u kterého Krajská hygienická stanice Jihočeského kraje hlásí výskyt sinic. Koupání tam zakázané není, ale citlivějším jedincům by mohlo způsobit zdravotní komplikace. Zákaz koupání stále platí v Orlické přehradě u Podolska.

U tábořiště Podolsko u orlické nádrže platí dočasný zákaz koupání. Kvalita vody se tam extrémně zhoršila, množství sinic přesahuje desetinásobek povolených hodnot. Kvalita vody se v kraji zhoršila na všech sledovaných místech. Nejlepší voda ke koupání ve sledovaných jihočeských lokalitách je nyní v lipenské přehradě na pláži u Horní Plané a na Radavě na Orlíku.

Koupací sezóna, která pravidelně začíná k prvnímu červnu, zaměstnává i jihočeské hygieniky. Ti kontrolují pravidelně ve dvoutýdenních intervalech, a podle potřeby i častěji, stanovené lokality koupacích vod v regionu. Patří sem autokemp Radava a veřejné tábořiště Podolsko na Orlíku, rekreační rybníky Hejtman a Staňkovský rybník na Jindřichohradecku a veřejné pláže v Černé v Pošumaví, v Lipně nad Vltavou a Horní Plané na vodní nádrži Lipno.